L'Institut National des Recherches Agricoles du Bénin est est placé sous tutelle du ministère en charge de l'agriculture.
Le siège social de l'Institut Nnational des Recherches Agricole du Bénin est fixé à Abomey-Calavi. Il peut-être transféré en tout autre lieu de la République du Bénin par décision du Cconseil des Misitres sur proposition du consiel d'administration de l'institut.
Les organes de l'Institut National des Recherches Agricoles du Bénin sont: le Conseil d'administration, la direction générale et le Conseil scientifique.